分子标记技术的发展为目标基因定位提供了新手段。本文在McMullen和Simcox(1995)的研究基础上综述了近几年来玉米抗病虫基因的分子标记定位最新研究结果，发现这些抗性基因或数量性状位点(QTL)均不同程度地连锁在一起，聚集成几群，位于染色体的特定区域。由于在同一聚群内经常发现不同抗性基因对不同病原菌(虫)的抗性反应，因此这些抗性基因间的功能关系目前还不清楚。研究抗病虫基因或OTL的染色体位置，发现许多抗性位点的产生与染色体片段重复有关。为应付快速演化的病原菌(虫)侵染，存在对新小种具有专化抗性的基因群是必要的。染色体上的特定区域在某一时期可能快速进化，以获得足够力量来抵抗共演化的病原菌(虫)的侵染。玉米抗病虫基因在染色体上聚群存在，可以用来提高克隆抗性基因的效率。