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1、2008年,由吉林省省委宣传部、省新闻出版局共同组织的第八次全省期刊等级评审中,玉米科学被评为“双十佳”期刊。玉米科学被评为一级期刊,从一级期刊中分别评选出自然科学类和社会科学类双十佳期刊,玉米科学被评为科技类十佳期刊。

2、2006年,在第五届全国农业期刊金犁奖评选活动中,玉米科学被评为学术类一等奖。

3、2002年,玉米科学获得第三届全国优秀农业期刊奖。

4、2009年1月,《玉米科学》获得期刊精品奖。吉林省新闻出版奖是省政府2005年设立,是吉林省出版行业的最高奖项。
 
5、在吉林省委宣传部、吉林省新闻出版局组织的第九届全省期刊等级评审中,玉米科学被评为一级期刊。在期刊等级评审的基础上,从一级期刊中分别评出自然科学类和社会科学类吉林名刊34种,其中自然科学类15种,玉米科学被评为吉林名刊。
 
6、2009年8月24日,第三届北方优秀期刊评选活动在辽宁省沈阳市进行。此次中国北方优秀期刊奖评选活动是继2004年河北和2007年黑龙江举办的北方优秀期刊评选活动后第三届,并更名为“中国北方优秀期刊评选活动”。此次评选活动得到了各有关省、市、区新闻出版局的积极推动和中国期刊协会的大力支持。有来自北京、天津、河北、山西、内蒙古、吉林、黑龙江、宁夏、甘肃、青海、辽宁等11个省、市、区的219种期刊参加评选。参评期刊数量、涉及地区均超过历届。玉米科学获中国北方优秀期刊奖。
 
7、由中国期刊评价委员会、武汉大学中国科学评价研究中心出版的《中国学术期刊评价研究报告》(2009-2010)中,《玉米科学》期刊被评为“RCCSE中国权威学术期刊".